More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2733 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  48.14 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  48.29 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  50.83 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  47.27 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 319 aa  255  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  44 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 315 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  44.01 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 323 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  39.4 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 353 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 341 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  38 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.55 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  31.85 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  36.03 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  33.67 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  29.26 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  34.8 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.38 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.38 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  22.48 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.63 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  22 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.16 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  22.15 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.15 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.15 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  22.15 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  22.15 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  26.13 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.2 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.8 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.08 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  22.07 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  37.35 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  20.48 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  24.9 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  23.79 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  24.35 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  33.96 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  23.79 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>