241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3642 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  67.99 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  57.76 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  58.69 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  60.93 
 
 		 315 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  55.45 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  58.28 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  58.88 
 
 		 312 aa  325  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  56.54 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  60.07 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  59.08 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  57.89 
 
 		 341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  56.87 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  55.74 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  52.12 
 
 		 308 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  35.67 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.4 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 351 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.62 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  35.02 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.33 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.03 
 
 		 426 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.47 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  36.24 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.41 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 353 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.34 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  30.83 
 
 		 345 aa  112  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  25.83 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.71 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.45 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.89 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  35.54 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.66 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  29.01 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  37.35 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.06 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.71 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.25 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  25 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  23.1 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.31 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.23 
 
 		 393 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>