251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1482 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  71.76 
 
 		 312 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  69.87 
 
 		 323 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  67.11 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  70.86 
 
 		 323 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  64.5 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  65.13 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  67.21 
 
 		 311 aa  364  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  62.25 
 
 		 319 aa  346  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 312 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  59.61 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  64.19 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 315 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  55.45 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  53.29 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  36.66 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.08 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.87 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  39.93 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  37.76 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.08 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  32.44 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  36.74 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.58 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.01 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  33.88 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  21.96 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  30.63 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.83 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  30.83 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  34.13 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  23.1 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.2 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  23.92 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.03 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.08 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.84 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.4 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  21.82 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  21.82 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>