More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4836 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 344 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  90.12 
 
 		 340 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  89.83 
 
 		 340 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  71.92 
 
 		 319 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  44.92 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  45.56 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  44.19 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  46.56 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  44.77 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  38.34 
 
 		 305 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  45.23 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  43.23 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  41.31 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  43.51 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  40.46 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  45.57 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  43.94 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.82 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 329 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  32.1 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.18 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  34.98 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.57 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.91 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  36.22 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.7 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  29.35 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  26.45 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.62 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.4 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.67 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.46 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  26.46 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.42 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  24.92 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  24.36 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.67 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.69 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  22.46 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  23.18 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.75 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  22.34 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  22.34 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  22.34 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>