276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0964 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 323 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  92.57 
 
 		 323 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  69.87 
 
 		 305 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  64.31 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  70.32 
 
 		 311 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  63.81 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  65.79 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  63.46 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  65.81 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  61.27 
 
 		 319 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  57.81 
 
 		 308 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  58.14 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  63.79 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  55.81 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.92 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  35.44 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 303 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.48 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.34 
 
 		 314 aa  175  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.02 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  34.02 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.15 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  33.72 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.69 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.09 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.06 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  21.21 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.01 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.12 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.19 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  20.76 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.22 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.9 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  21.75 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.86 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  24.71 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  22.75 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  31.58 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  26.05 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  23.46 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  28.69 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.44 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  30.86 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  25.44 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25.44 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.44 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.44 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25.44 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.85 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  23 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  25 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.36 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>