More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1222 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 335 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  67.11 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  61.71 
 
 		 312 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  69.55 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  62.62 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  62.73 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  61.84 
 
 		 312 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  60.53 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  56.66 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  60.97 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  59.02 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  59.02 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  57.76 
 
 		 306 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  53.09 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  57.32 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.2 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  40.85 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  37.09 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.33 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  36.79 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.4 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  35.63 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  33.9 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.51 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.96 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.75 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.41 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  22.95 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.37 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  34.23 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  30 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  20.45 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  27.64 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  24.52 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.05 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 		 445 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.18 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.64 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  25.36 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  25.36 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  25.36 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.23 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  21.59 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  24.09 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>