253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 351 aa  706    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  50.99 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  49.2 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  45.76 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  45.7 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  46.13 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  45 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 297 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  44.85 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  44.81 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 317 aa  232  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  48.38 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  42.69 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 323 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.02 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  37.18 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 305 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.8 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.84 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 365 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  35.78 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  30.84 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.7 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  29.79 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.64 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.9 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.9 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  26.45 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  23.65 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  23.65 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  23.65 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  23.65 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  20.66 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25.1 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  24.71 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  26.26 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  23.43 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  23.43 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  24.31 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  23.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.31 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.31 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  23.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  24.31 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  24.31 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  24.34 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  29.31 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  26.75 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  24.36 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  22.98 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.32 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>