253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4358 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
312 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  71.76 
 
 
305 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  64.31 
 
 
323 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 
311 aa  384  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  63.12 
 
 
335 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  64.31 
 
 
323 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  59.74 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  61.59 
 
 
312 aa  348  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  61.26 
 
 
309 aa  338  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
319 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  58.09 
 
 
308 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  61.86 
 
 
318 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  58.73 
 
 
315 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  55.13 
 
 
317 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 
306 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  54.15 
 
 
305 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  53.14 
 
 
341 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  55.99 
 
 
308 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 
331 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  40.73 
 
 
314 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 
351 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  36.45 
 
 
321 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 
319 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  35.03 
 
 
363 aa  182  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
315 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  38.08 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 
323 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 
297 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
305 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 
317 aa  175  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 
303 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 
344 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 
340 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.32 
 
 
327 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.78 
 
 
310 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 
317 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
317 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  35.57 
 
 
310 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
318 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 
321 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 
316 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
283 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
426 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
353 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 
326 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 
333 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 
302 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
327 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 
330 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.93 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 
353 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
321 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.82 
 
 
345 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  25.59 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.05 
 
 
393 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.39 
 
 
393 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  31.58 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  25.08 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.1 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.51 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  23.97 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  30.19 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  30.19 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  30.19 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  30.19 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  30.19 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  30.19 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  23.97 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  23.97 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.95 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  30.19 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  30.19 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  23.97 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  30.19 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.17 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>