213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1593 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  59.14 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  59.11 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  56.51 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  36.98 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  36.29 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  32.98 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  34.19 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  31.3 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  33.64 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  30.55 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.8 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  29.39 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40.09 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  31.2 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  37.65 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.04 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.86 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  26.43 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.46 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.18 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  21.09 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.37 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  21.46 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.33 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.25 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  32.23 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.64 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  23.11 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.11 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  22.9 
 
 		 422 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>