More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2294 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  84.19 
 
 		 315 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  44.95 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  39.73 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  41.24 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.54 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  44.29 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  43.27 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  43.34 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  41.56 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  47.74 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  42.68 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  43.89 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.36 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  34.51 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  29.85 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.85 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  31.91 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.01 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.03 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.97 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.36 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  26 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.57 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  25.91 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  24.57 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.84 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  29.93 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  23.17 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  23.68 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>