More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1307 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 321 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 		 326 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  31.16 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  33.11 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  33.54 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.69 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  33.73 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  29.22 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  32.74 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  30.57 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.32 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  29.56 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  28.53 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  28.21 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  28.53 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  29.58 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  27.35 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  23.37 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  23.84 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.7 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  23.18 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  23.36 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  23.53 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.7 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  22.41 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  24.88 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.07 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  21.96 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  19.3 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  20.99 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  19.75 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  22.79 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  21.31 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  22.96 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  21.6 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  23.59 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  23.1 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  22.46 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  23.26 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  19.74 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  21.28 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  22.08 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  21.24 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  20.95 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  22.54 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  22.48 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>