More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1671 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 341 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  73.48 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  56.15 
 
 		 323 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  56.29 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  53.95 
 
 		 335 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  55.67 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 		 323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  56.87 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  57.89 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  53.14 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  50.62 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  54.3 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  54.3 
 
 		 315 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  52.81 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  54.52 
 
 		 318 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  51.67 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.36 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  39.06 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  39.45 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  41.9 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  35.6 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  41 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.02 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.92 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  37.08 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  28.52 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.41 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.24 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  26.77 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.4 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  21.48 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  26.69 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  28.31 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  27.68 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.88 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.75 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  24.9 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  25.56 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  24.74 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.93 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  24.43 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.34 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.47 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  23.25 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.37 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  24.02 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  20.96 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  29.91 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  24.61 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.42 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  27.44 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.77 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  22.68 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  34.78 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>