More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0824 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
323 aa  652    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  65.63 
 
 
317 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  61.42 
 
 
363 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  34.25 
 
 
321 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 
319 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 
305 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 
331 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 
305 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 
303 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 
312 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
323 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 
309 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
300 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 
351 aa  172  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  34.06 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
326 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 
335 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.68 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.34 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
312 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 
317 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 
340 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 
318 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  34.1 
 
 
315 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  30.79 
 
 
340 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 
283 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
353 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
306 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 
318 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 
308 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 
341 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
298 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  30.84 
 
 
315 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  31.23 
 
 
310 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 
318 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
426 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 
310 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
353 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 
321 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 
327 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.75 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
318 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.91 
 
 
314 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  31.03 
 
 
327 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.79 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
365 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  26.67 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.63 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.18 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  22.47 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 
478 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  25.45 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  27.51 
 
 
460 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 
460 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  27.24 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.83 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  23.95 
 
 
300 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  20.45 
 
 
293 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.97 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  26.05 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  21.97 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  21.97 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.91 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  27.3 
 
 
462 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.3 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  21.16 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  34.29 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  22.3 
 
 
296 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.3 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 
301 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.73 
 
 
300 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  24.11 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  26.05 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>