208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4489 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
298 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  56.67 
 
 
344 aa  331  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 
302 aa  322  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  58.76 
 
 
321 aa  308  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  54.03 
 
 
330 aa  302  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  51.35 
 
 
329 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  48.63 
 
 
365 aa  292  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  52.96 
 
 
333 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 
318 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 
319 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  49.22 
 
 
353 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  39.76 
 
 
308 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
283 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
351 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.99 
 
 
321 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 
305 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
323 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 
317 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 
331 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 
312 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  35.91 
 
 
310 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 
317 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
317 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 
306 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
303 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 
315 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 
315 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 
318 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
297 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  33.59 
 
 
319 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 
300 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
426 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.58 
 
 
336 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
326 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  38.14 
 
 
308 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 
323 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
310 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  31.03 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.63 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
301 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 
308 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  28.26 
 
 
340 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  28.26 
 
 
340 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 
311 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  31.99 
 
 
345 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  38.4 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.4 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  28.67 
 
 
314 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  22.84 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
388 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.71 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.36 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  24.32 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  27.73 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  25.47 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  31.76 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  33.75 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  24.6 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  24.2 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  33.75 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  31.76 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.76 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.76 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  31.76 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  31.76 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  31.76 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  23.18 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  21.75 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  21.75 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  23.18 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  21.75 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  23.18 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  23.18 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  21.65 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>