More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1782 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  100 
 
 		 321 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  56.8 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  48.87 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  48.14 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  47.78 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  43.93 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  45.19 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  42.3 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 426 aa  218  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  37.98 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  35.44 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  43.5 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 363 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.57 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  38.99 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.6 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.35 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  28.43 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.81 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  28.21 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.96 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.46 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.41 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.46 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  23.57 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.63 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  23.16 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  23.16 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  23.16 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  22.81 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  21.75 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  26.35 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  22.81 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  21.75 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  22.63 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>