More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1776 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
331 aa  656    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  50.33 
 
 
310 aa  298  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  54.11 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  50.72 
 
 
283 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  51 
 
 
303 aa  272  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  43.93 
 
 
321 aa  268  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  40.43 
 
 
312 aa  258  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  44.85 
 
 
351 aa  255  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 
316 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 
297 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  48.65 
 
 
308 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 
300 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  45.56 
 
 
344 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
305 aa  248  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  49.2 
 
 
318 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 
340 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  44.82 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  39.61 
 
 
426 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 
312 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 
315 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  38.34 
 
 
317 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 
305 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  37.3 
 
 
363 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 
319 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 
312 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 
323 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 
323 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  38 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 
341 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 
327 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  40.8 
 
 
308 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 
318 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 
306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  38.26 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  41 
 
 
311 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 
326 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 
301 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 
318 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 
321 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 
353 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
308 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 
333 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.99 
 
 
327 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 
344 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
365 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.21 
 
 
314 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 
310 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.41 
 
 
336 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  32.8 
 
 
330 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 
302 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  34.16 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 
392 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.71 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  27.27 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  25.59 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.74 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.83 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  25.38 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  28.34 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  21.1 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.93 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.96 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  23.16 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  27.48 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  26.21 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  25.56 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  23.31 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 
295 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  26.44 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.14 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25.09 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  21.47 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>