276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0901 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
323 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  92.57 
 
 
323 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  70.36 
 
 
305 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  64.31 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  64.13 
 
 
318 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  70.26 
 
 
311 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  64.57 
 
 
335 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  64.78 
 
 
312 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  65.81 
 
 
309 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  62.54 
 
 
319 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  68.28 
 
 
318 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  65.58 
 
 
315 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  59.8 
 
 
317 aa  339  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 
308 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 
305 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  60.07 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  54.92 
 
 
341 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  64.12 
 
 
308 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
308 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
300 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  38.32 
 
 
331 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 
310 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 
323 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 
340 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 
340 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  35.48 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  36.91 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 
305 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40.82 
 
 
327 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.95 
 
 
314 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 
363 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  34.71 
 
 
310 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
297 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.02 
 
 
353 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.9 
 
 
317 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 
329 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 
316 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
426 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 
318 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 
298 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  35.63 
 
 
344 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
326 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 
365 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 
330 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
321 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 
333 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 
302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 
318 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
353 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  29.46 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.82 
 
 
345 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 
321 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  22.35 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.62 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.42 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.3 
 
 
388 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  26.43 
 
 
393 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  23.88 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  25.71 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.34 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  20.76 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  23.79 
 
 
395 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  30.07 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  31.03 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  25.96 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  23.65 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  20.53 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  20.53 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  25.76 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  20.53 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  28.45 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.14 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25.58 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  26.74 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.58 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25.58 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  23.36 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  27.56 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>