More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0719 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 317 aa  639    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  50.83 
 
 		 351 aa  315  5e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  48.87 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  46.96 
 
 		 312 aa  292  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  45.05 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 303 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  44.88 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 426 aa  245  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  44.82 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  41.46 
 
 		 319 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  49.12 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  41.27 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  36.04 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 326 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.78 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.85 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  30.87 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  28.97 
 
 		 345 aa  95.9  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  26.43 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  26.79 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  28.46 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  28.08 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.07 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.07 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.37 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.81 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  21.28 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  22.11 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  26.48 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  23.74 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.73 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  25.82 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  24.1 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  22.87 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.36 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.47 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>