299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4060 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  74.67 
 
 		 309 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  72.4 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  65.81 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  64.59 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  65.58 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  60.84 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  59.49 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  60.73 
 
 		 305 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  59.02 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  56.37 
 
 		 317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  61.61 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  60.46 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  60.13 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  55.45 
 
 		 308 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  59.33 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  54.3 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.78 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  40.4 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  39.4 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41.08 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  38.76 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  37.24 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 		 344 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  39.73 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.88 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  28.79 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  36.27 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.33 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.18 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.53 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.32 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  20.81 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  22.42 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  24.36 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.03 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.11 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  22.22 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  28.06 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  21.83 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  22.29 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.29 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  22.39 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  22.39 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  21.57 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  21.57 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  23.45 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  21.57 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.04 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.12 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>