More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1360 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  48.11 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  50.53 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  46.26 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  46.28 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  48.65 
 
 		 331 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 319 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  43.4 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  42.19 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 319 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  43.24 
 
 		 426 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  43.45 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  45.15 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  39.61 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  44.09 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.77 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 		 363 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  37.29 
 
 		 327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.33 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.09 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  36.95 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  25.83 
 
 		 369 aa  86.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.96 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  19.79 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  19.79 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  21.72 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  19.79 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.84 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  22.87 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  24.91 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  25.83 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  24.14 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.72 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  24.51 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  22.82 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  22.58 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  21.75 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.5 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  22.38 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  24.07 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  23.32 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  33.73 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  33.73 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  22.14 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  33.73 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  33.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  33.73 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>