More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4986 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  73.27 
 
 		 308 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  63.81 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  65.13 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  64.13 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  59.74 
 
 		 312 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  63.7 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  62.17 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  60.7 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  60.7 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  64.9 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  61.94 
 
 		 318 aa  352  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  60.45 
 
 		 315 aa  348  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  57.69 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  56.44 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  56.54 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  58.8 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 341 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  43.45 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  35.67 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  35.08 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  41 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  36.33 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  41.74 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  36.27 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.85 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 		 426 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  36 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 		 344 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.62 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.32 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  36.1 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  24.1 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.13 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.39 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.07 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  24.92 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  26.29 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.49 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  22.29 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  22.47 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.69 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  21.86 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  27.56 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  24.05 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  25.29 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1119  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.194456  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  24.53 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  23.66 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.09 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  20.88 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  24.75 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.72 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  21.93 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>