More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1617 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 313 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 		 459 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 		 460 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 		 445 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  27.74 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  26.77 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.55 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.21 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  21.83 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  26.21 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  26.21 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  26.39 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  26.39 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  26.39 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  26.39 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  26.39 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  26.39 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.23 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  31.61 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  26.39 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  23.77 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  27.1 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  28.19 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  28.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.09 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.33 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.02 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.06 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.48 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.75 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  28.02 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.72 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  28.09 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  24.57 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  21.91 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.7 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  23.63 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  24.45 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  23.79 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.85 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  27.56 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  25 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  22.85 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  25.58 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.87 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  26.61 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33.19 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  25 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  24.45 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  24.35 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  26.74 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 476 aa  69.3  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>