287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1390 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  75.33 
 
 		 319 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  74.67 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  64.5 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  65.79 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  63.7 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  65.81 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  61.26 
 
 		 312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  59.55 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  60.73 
 
 		 305 aa  345  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  64.59 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  58.69 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  59.34 
 
 		 335 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  62.9 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.97 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  44.7 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  41.75 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  38.28 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  40 
 
 		 327 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 353 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.17 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  37.87 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.56 
 
 		 336 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.12 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  25.26 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.91 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.15 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.5 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  22.37 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  21.38 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.15 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.25 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  23.36 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.43 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.49 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  24.55 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  23.79 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  24.1 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  24.09 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  23.24 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  21.02 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  21.62 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.07 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  21.88 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.84 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  21.32 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  21.32 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  22.83 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>