More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0314 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 315 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  83.72 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  52.63 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  47.48 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  46.26 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  46.51 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  44.83 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  42.07 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  39.09 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  37.7 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  40.52 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 		 335 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  37.93 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 426 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.72 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  35.25 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  33.12 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.68 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  24.48 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  28.45 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  25.88 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  24.58 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  26.36 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.36 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  27.83 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  27.45 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  26.84 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  27.63 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  26.25 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  26.86 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  22.91 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  24.22 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  22.95 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>