More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5899 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 312 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  63.46 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  64.78 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  61.59 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 305 aa  364  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  60.7 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  61.17 
 
 		 319 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  64.59 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  61.84 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  64.36 
 
 		 311 aa  344  8.999999999999999e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  60.2 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  61.74 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  58.06 
 
 		 317 aa  334  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  58.88 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  53.31 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  60.07 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  54.3 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.47 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.28 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  39.61 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  37.71 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 340 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  36.08 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  39.8 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  38.55 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.42 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 426 aa  163  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  36.24 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.78 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.19 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.46 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  25.78 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.47 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  28.79 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  23.84 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  21.5 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  25.82 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  25.27 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.06 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  22.44 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  27.74 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.42 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  29.03 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  26.9 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.08 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.58 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  26.76 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  23.55 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.34 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.71 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.71 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  21.97 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  27.46 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>