193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4110 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 317 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  54.97 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  55.32 
 
 		 283 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  44.75 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  43.73 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  41.25 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  44.83 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 426 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.68 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 		 363 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 365 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.68 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  33.57 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  31.48 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  30.9 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  23.86 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.54 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  21.4 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.4 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  26.76 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  20.81 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  25.94 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.03 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  21.98 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  23.18 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.11 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.29 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.53 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.53 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  35.53 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>