289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 426 aa  862    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  49.2 
 
 		 351 aa  309  8e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  43.14 
 
 		 305 aa  249  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  41.53 
 
 		 312 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 297 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 317 aa  247  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 300 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.32 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  39.23 
 
 		 310 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 319 aa  220  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  43.24 
 
 		 308 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 317 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 		 303 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 		 305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 318 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 309 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  35.03 
 
 		 306 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  30.55 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 308 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 353 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 		 308 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  27.1 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 		 353 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 301 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  27.55 
 
 		 336 aa  123  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  29.64 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  28.75 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  27.94 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 302 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.22 
 
 		 345 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 		 293 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  23.05 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  24.46 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  20.54 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  21.99 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  23.99 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  21.55 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.98 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  20.79 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  23.28 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.12 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.53 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  21.86 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  21.86 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  24.83 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  24.83 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  20.61 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  21.51 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  21.51 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  21.51 
 
 		 296 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  24.48 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  22.57 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  24.12 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.81 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  22.73 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>