More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4570 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  63.79 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  64.12 
 
 		 323 aa  354  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  60.07 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  58.8 
 
 		 318 aa  348  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  60.26 
 
 		 335 aa  346  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  59.47 
 
 		 309 aa  343  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  56.31 
 
 		 312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  59.33 
 
 		 315 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  56.33 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  58.23 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  57.57 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  54.49 
 
 		 305 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  58.88 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  52.12 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  51.67 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 344 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40.51 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  43.1 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  39.38 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  37.84 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  38.05 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  38.38 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.02 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 		 363 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.17 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  38.54 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  31.56 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 		 353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  28.85 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  32.23 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  32.23 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.6 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  36.61 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.09 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.36 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  21.01 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.71 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  28.82 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.25 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  25.56 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.33 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.38 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.21 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  26.87 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  26.32 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.32 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  26.32 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>