More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4688 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 340 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  98.82 
 
 		 340 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  90.12 
 
 		 344 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  71.61 
 
 		 319 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  42.95 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 		 300 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  46.89 
 
 		 303 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  44.77 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 351 aa  235  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  42.86 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  43.65 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  44.06 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 426 aa  185  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 301 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  32.71 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.89 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.32 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  34.65 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  32.91 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  34.3 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 333 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  29.97 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  25.96 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.59 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  23.59 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  24.41 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.64 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.67 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.43 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  22.42 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  26.3 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  33.9 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  24.18 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.84 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  26.91 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  26.07 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  23.69 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.73 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.17 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.17 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  37.17 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>