More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20770 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
380 aa  750    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  56.37 
 
 
374 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 
369 aa  371  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  47.28 
 
 
390 aa  332  9e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  38.21 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  32.43 
 
 
393 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  32.15 
 
 
393 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  30.08 
 
 
392 aa  206  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
333 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 
388 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  32.8 
 
 
293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  32.1 
 
 
319 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.72 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 
306 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  26.02 
 
 
422 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 
396 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 
337 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  25.83 
 
 
315 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 
310 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  24.55 
 
 
323 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 
409 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 
294 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  27.23 
 
 
313 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  29.11 
 
 
297 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 
300 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.71 
 
 
309 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.04 
 
 
298 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  28.69 
 
 
297 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.69 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.69 
 
 
297 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.69 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.69 
 
 
298 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.69 
 
 
297 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
385 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  28.69 
 
 
297 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.79 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.76 
 
 
297 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  30.18 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 
297 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 
318 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
291 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  28.41 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
278 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.9 
 
 
305 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 
299 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 
299 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
308 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
302 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.98 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.18 
 
 
292 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 
299 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
307 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.51 
 
 
401 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
292 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 
313 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  29.55 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  27.14 
 
 
314 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  26.71 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 
315 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 
320 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  27.07 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.02 
 
 
389 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 
307 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 
341 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
299 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.45 
 
 
311 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
298 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  27.13 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  28.4 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>