More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04870 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
374 aa  741    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  56.37 
 
 
380 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  46.61 
 
 
369 aa  344  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  38.81 
 
 
372 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  31.71 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  31.44 
 
 
393 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  35.87 
 
 
333 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
388 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  29.96 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
311 aa  123  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 
422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.45 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 
306 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  28.57 
 
 
313 aa  110  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.22 
 
 
297 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.22 
 
 
298 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.22 
 
 
297 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.22 
 
 
298 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.22 
 
 
298 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.87 
 
 
297 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
297 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  28.52 
 
 
297 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  28.91 
 
 
297 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.87 
 
 
298 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  25.36 
 
 
331 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 
315 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
396 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
291 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.14 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
310 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 
292 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
294 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  25.26 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  26.82 
 
 
295 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
385 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 
385 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  25.88 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  25.66 
 
 
385 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 
294 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  26.2 
 
 
309 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.76 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  29.96 
 
 
380 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  25.19 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  23.69 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  27.78 
 
 
317 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 
303 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  28.57 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 
293 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  25.19 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  26.19 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  26.43 
 
 
292 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  23.4 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.18 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.37 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  23.02 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  24.8 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  27.98 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  26.12 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 
423 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  24.83 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  27.05 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  23.55 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  27.19 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  25.26 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>