More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4176 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
318 aa  634    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  58.75 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 
298 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
329 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 
344 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  43.61 
 
 
321 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  45.69 
 
 
353 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 
302 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  37.98 
 
 
321 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 
365 aa  189  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 
319 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 
308 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 
309 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 
351 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
333 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  36.61 
 
 
310 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 
317 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 
335 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 
317 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 
331 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 
308 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
305 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 
319 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 
300 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
326 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 
310 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 
344 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 
318 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 
312 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 
323 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 
340 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 
323 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 
301 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  35.84 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 
315 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 
323 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
363 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
308 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 
315 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
317 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 
306 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 
341 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 
283 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.17 
 
 
317 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 
311 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.7 
 
 
336 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 
353 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.23 
 
 
327 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
303 aa  139  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
318 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.96 
 
 
345 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  31.54 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  23.15 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  24.76 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.68 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  22.57 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.93 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  32.74 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  32.74 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.74 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.74 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  32.74 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  32.74 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  32.74 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  23.13 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.52 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.52 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.68 
 
 
393 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.68 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  22.04 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 
422 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  22.85 
 
 
301 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  24.1 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  23.78 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  22.19 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  23.78 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  25.7 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  22.86 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>