More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0438 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  59.6 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  54 
 
 		 300 aa  346  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  48.15 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  44.33 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 351 aa  261  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  45.05 
 
 		 317 aa  252  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  40.34 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  43.14 
 
 		 426 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  38.94 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 318 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  38.34 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 		 327 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  32.39 
 
 		 363 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.19 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  33.07 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  30.49 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  30.71 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  31.3 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 333 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.8 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  27.11 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.62 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  21.55 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  27.23 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  23.1 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  36.25 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.25 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.25 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  36.25 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  36.25 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  36.25 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  36.25 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  35 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  35 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  25.45 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  26.11 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.52 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.89 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  24.89 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  23.65 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.38 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.1 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.45 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  19.12 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.1 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  19.52 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  19.52 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  23.17 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>