More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3754 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 319 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  71.92 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  71.61 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  71.61 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  46 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  42.72 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  44.81 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  47.6 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.58 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  46.45 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  42.81 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  41.83 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  46.6 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  41.9 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  43.14 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.95 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  41.53 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  34.82 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 318 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  40.63 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.62 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.54 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.46 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.51 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  32.42 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.56 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.56 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.29 
 
 		 392 aa  85.9  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.6 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  26.26 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  23.05 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  25.17 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  25.18 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.76 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.09 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.08 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  24.67 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  21.73 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  24.5 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  20.91 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.57 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  26.76 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.07 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  22.56 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  22.22 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>