283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1771 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  100 
 
 		 312 aa  626  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  56.8 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  48.15 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  48.18 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  43.6 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  43.06 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.28 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  48.46 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  44 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  44.25 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  44.25 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  44.25 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  39.42 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  39.57 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  33.01 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  35.25 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  30.84 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  28.4 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  29.53 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  36.27 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  28.79 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  29.77 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  22.11 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  25.79 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.41 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  25.8 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  24.3 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  22.44 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  24.51 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  21.86 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.2 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  22.84 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  22.84 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  23.1 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  21.66 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  22.67 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.86 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  22.84 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  21.38 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  38.3 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  26.09 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  21.92 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  25.87 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>