222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0065 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
329 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  68 
 
 
321 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  59.14 
 
 
302 aa  308  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 
344 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  51.35 
 
 
298 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 
333 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 
365 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  54.18 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
318 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 
327 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  37.89 
 
 
353 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  34.51 
 
 
321 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 
317 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  38.15 
 
 
308 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  38.18 
 
 
345 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  40.52 
 
 
353 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 
319 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 
308 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
283 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 
331 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 
323 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 
312 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  31.44 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 
344 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
303 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  30.18 
 
 
312 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 
319 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  34.7 
 
 
300 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 
301 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.1 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
315 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
326 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 
323 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 
305 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 
316 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  38.55 
 
 
327 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
426 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 
321 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
318 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  29.28 
 
 
314 aa  106  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 
317 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  21.64 
 
 
300 aa  59.3  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.54 
 
 
392 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.39 
 
 
393 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.39 
 
 
393 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  28.29 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  30 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  37.27 
 
 
298 aa  53.5  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.53 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.01 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.14 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  23.46 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  25 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  29.31 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  26.55 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>