268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0337 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
317 aa  641    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  63.49 
 
 
363 aa  411  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  65.02 
 
 
323 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 
312 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 
303 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 
305 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  32.58 
 
 
321 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  32.8 
 
 
351 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 
335 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
318 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 
323 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
317 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
312 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 
319 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 
305 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
308 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 
308 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  30.35 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 
306 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 
309 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 
323 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 
317 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
353 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 
305 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
317 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  31.17 
 
 
318 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 
297 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  30.89 
 
 
340 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 
340 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 
301 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 
344 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 
426 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
283 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
315 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.48 
 
 
314 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  29.22 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.29 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.22 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 
321 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
318 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 
344 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  31.1 
 
 
345 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
302 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
316 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  27.81 
 
 
329 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  29.26 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  26.23 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.02 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  24.36 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  25.74 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  23.91 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  23.45 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  25.6 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  23.53 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  23.2 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  22.88 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.88 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.88 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  22.88 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  25.75 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  22.88 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  24.52 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.2 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  23.53 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  22.88 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  25.79 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.1 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  25.1 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  22.78 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  28.09 
 
 
479 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.55 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  22.19 
 
 
296 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  25.1 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>