201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4528 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  93.69 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  85.38 
 
 		 308 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  56.76 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  35.93 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  35.71 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  44.08 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  33.68 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 319 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  38.76 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  35.2 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  29.91 
 
 		 353 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  39.24 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.22 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  30.77 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 426 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  37.34 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.44 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.01 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  33.07 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  24.42 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.18 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  21.76 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  37.18 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  30.84 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  40.3 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  29.1 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  20.85 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  20.85 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.35 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  23.53 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  23.43 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 459 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.51 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>