More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  66.42 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  64.21 
 
 		 271 aa  345  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  60.45 
 
 		 279 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  57.09 
 
 		 326 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  59.71 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  61.17 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  58.8 
 
 		 270 aa  308  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  61.13 
 
 		 272 aa  288  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  56.04 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  56.04 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  56.04 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  51.49 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  57.92 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  56.57 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  59.66 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  53.73 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  50.38 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  48.16 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  30.62 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  31.79 
 
 		 364 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  29.54 
 
 		 353 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  29.89 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.57 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  28.37 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.52 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.62 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.76 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  28.98 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  28.98 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.23 
 
 		 476 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  24.48 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.43 
 
 		 966 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.63 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.53 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  32.87 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.95 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  25.78 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.6 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  39.17 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  24.04 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  31.34 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.57 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  25.8 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.36 
 
 		 422 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  30.6 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  27.36 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30.46 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  35 
 
 		 635 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.44 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.91 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  33.77 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.04 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  38.35 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.37 
 
 		 582 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.43 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  30.54 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.76 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.59 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.13 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  31.13 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.02 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  29.45 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  25.27 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.13 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  28.28 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  24.78 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  22.42 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.61 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  23.75 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  30.46 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  25.28 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  23.45 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.3 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  32.58 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.63 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  30.54 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  25.36 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  34.97 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.61 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.09 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.68 
 
 		 446 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  23.82 
 
 		 395 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  22.97 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.06 
 
 		 834 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.69 
 
 		 5698 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  22.76 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  22.76 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.37 
 
 		 611 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  26 
 
 		 792 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  29.53 
 
 		 670 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25 
 
 		 793 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  27.81 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.08 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.71 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.67 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  24.35 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.79 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.3 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>