299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1189 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  60.45 
 
 		 271 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  56.67 
 
 		 270 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  54.81 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  53.16 
 
 		 270 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  49.44 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  53.14 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  52.69 
 
 		 326 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  50.55 
 
 		 274 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  55.15 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  51.29 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  51.29 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  51.29 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  49.8 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  50.21 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  47.9 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  45.9 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  47.47 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  44.92 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  29.41 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.96 
 
 		 364 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  30.56 
 
 		 354 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  30.47 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.08 
 
 		 966 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  34 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.51 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  28.16 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  28.06 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.71 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  27.94 
 
 		 358 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.5 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.5 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  36.09 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  24.83 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  26.6 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  27.44 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  24.01 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  22.74 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  25.15 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  26.71 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.3 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  27.01 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.21 
 
 		 582 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  24.7 
 
 		 454 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28.06 
 
 		 784 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  25.82 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25.26 
 
 		 793 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  21.95 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  33.33 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  24.76 
 
 		 717 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  26.9 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.87 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  20.96 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  23.24 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.84 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  32.14 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.15 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  22.51 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  26.98 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  29.03 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.77 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.98 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.86 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  24.45 
 
 		 405 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.94 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  33.08 
 
 		 555 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  24.36 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  29.82 
 
 		 441 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  26.06 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.92 
 
 		 437 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  24.29 
 
 		 792 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.35 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.06 
 
 		 559 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  33.33 
 
 		 491 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.08 
 
 		 446 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  25 
 
 		 785 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.14 
 
 		 422 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  29.77 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  28.26 
 
 		 524 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  24.2 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.28 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  28.97 
 
 		 419 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  32.17 
 
 		 560 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.95 
 
 		 351 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  31.16 
 
 		 417 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  27.11 
 
 		 415 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  28.37 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  22.55 
 
 		 379 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  22.93 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.2 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  22.47 
 
 		 614 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  33.08 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  28.35 
 
 		 590 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.99 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.4 
 
 		 1012 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.52 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  27.12 
 
 		 677 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.46 
 
 		 445 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.31 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.3 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>