274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3764 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  82.12 
 
 
274 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  72.79 
 
 
274 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  72.79 
 
 
274 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  72.79 
 
 
274 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  71.96 
 
 
272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  61.17 
 
 
271 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  59.7 
 
 
270 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  55.51 
 
 
270 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  57.35 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  52.92 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  53.14 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  53.63 
 
 
292 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  48.15 
 
 
273 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  52.63 
 
 
291 aa  244  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  50 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  48.53 
 
 
269 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  51.9 
 
 
270 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  48.68 
 
 
283 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.82 
 
 
364 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  30.1 
 
 
370 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  29.54 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  26.5 
 
 
966 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  29.03 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  27.54 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  22.18 
 
 
395 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  22.87 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  28.38 
 
 
792 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  24.36 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  28.43 
 
 
785 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.18 
 
 
416 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  22.97 
 
 
381 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.15 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.26 
 
 
381 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  25.54 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  34.06 
 
 
358 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.54 
 
 
430 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.43 
 
 
574 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  23.2 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.51 
 
 
784 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0240  beta-lactamase  27.91 
 
 
348 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.52 
 
 
635 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  22.19 
 
 
379 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  22.7 
 
 
385 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  25.27 
 
 
452 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  23.67 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  26.62 
 
 
796 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.57 
 
 
378 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  25.69 
 
 
566 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  25.27 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  25.94 
 
 
459 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  26.62 
 
 
796 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.91 
 
 
403 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.31 
 
 
490 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.43 
 
 
533 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  24.92 
 
 
390 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  29.41 
 
 
553 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.83 
 
 
356 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  29.93 
 
 
547 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  26.91 
 
 
790 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  34.93 
 
 
560 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  24.91 
 
 
793 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.88 
 
 
582 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.44 
 
 
483 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  27.99 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.56 
 
 
392 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  26.58 
 
 
450 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.53 
 
 
508 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.41 
 
 
481 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.74 
 
 
483 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  28.86 
 
 
513 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  28.91 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.74 
 
 
501 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  28.99 
 
 
778 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.44 
 
 
483 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  33.8 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.7 
 
 
481 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.51 
 
 
422 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  24.37 
 
 
717 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.7 
 
 
463 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.7 
 
 
481 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.86 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.09 
 
 
476 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.59 
 
 
497 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  27.66 
 
 
494 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  24.56 
 
 
445 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  33.33 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
481 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  28.25 
 
 
478 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  26.35 
 
 
374 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  28.47 
 
 
513 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.81 
 
 
677 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.44 
 
 
483 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  26.56 
 
 
405 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.52 
 
 
510 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.26 
 
 
388 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  24.1 
 
 
455 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.22 
 
 
442 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.63 
 
 
476 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  24.1 
 
 
377 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>