More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3377 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  72.79 
 
 		 274 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  72.06 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  72.69 
 
 		 272 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  58.96 
 
 		 270 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  57.35 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  57.51 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  56.25 
 
 		 271 aa  291  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  53.12 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  52.03 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  53.29 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  51.88 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  49.25 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  50.61 
 
 		 291 aa  238  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  49.58 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  47.43 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  49.06 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  31.33 
 
 		 370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  30.33 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  29.45 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  28.62 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  32.35 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  28.26 
 
 		 966 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  23.18 
 
 		 395 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.1 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  25.58 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  28.05 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  26.51 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  26.83 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.47 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.57 
 
 		 452 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  21.93 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.57 
 
 		 428 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1072  beta-lactamase  26.5 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.81 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.58 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  26.94 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  27.04 
 
 		 405 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.57 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  27.27 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.18 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  25.45 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.16 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.41 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  25.35 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  35.17 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  27.56 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  25.89 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  28.75 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  32.88 
 
 		 784 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  24.83 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  29.17 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  23.78 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  23.48 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.87 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.68 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  23.91 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  34.06 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  22.76 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 513 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  29.17 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  29.2 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.08 
 
 		 582 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.8 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  26.26 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  36.15 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  31.88 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  24.51 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3473  beta-lactamase  25.36 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.407682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  36.63 
 
 		 491 aa  55.8  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  25.36 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  25.17 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  29.1 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  31.16 
 
 		 778 aa  55.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  23.57 
 
 		 796 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  25.33 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  23.57 
 
 		 796 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.14 
 
 		 508 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.25 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.5 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  24.06 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  26.85 
 
 		 790 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  22.34 
 
 		 511 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  25.55 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  30.94 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  29.5 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  24.56 
 
 		 445 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.61 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  26.39 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  30.15 
 
 		 553 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.17 
 
 		 497 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.29 
 
 		 559 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  27.52 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3659  beta-lactamase  27.56 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 340 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 340 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  23.81 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  24.56 
 
 		 391 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>