73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26900 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  48.53 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  48.16 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  43.77 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  47.76 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  44.12 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  45.27 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  45.85 
 
 		 270 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  44.92 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  47.19 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  48.07 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  48.07 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  48.07 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  47.81 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  42.22 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  41.42 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  44.58 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  40.38 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  41 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.98 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  22.15 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  24.38 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  28.1 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  25.62 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.33 
 
 		 356 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.81 
 
 		 501 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  24.26 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  25.19 
 
 		 354 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1900  beta-lactamase  26.9 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  28.93 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  25.83 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  22.68 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.71 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  27.44 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  32.23 
 
 		 389 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  21.93 
 
 		 385 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2834  beta-lactamase  26.67 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4495  Beta-lactamase  26.07 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  29.92 
 
 		 459 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.53 
 
 		 379 aa  45.4  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  30.58 
 
 		 389 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3756  beta-lactamase  29.85 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  29.03 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  30.71 
 
 		 380 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  27.35 
 
 		 590 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  27.48 
 
 		 555 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.21 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.05 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  28.46 
 
 		 677 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.88 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.52 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  30.88 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  25.38 
 
 		 459 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  23.31 
 
 		 454 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.23 
 
 		 476 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.77 
 
 		 507 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.47 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.21 
 
 		 388 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  32.56 
 
 		 530 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.85 
 
 		 442 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  22.01 
 
 		 430 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  25.83 
 
 		 385 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.81 
 
 		 392 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  24.79 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  26.81 
 
 		 657 aa  42  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>