More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2729 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  60.38 
 
 		 270 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  56.18 
 
 		 271 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  51.49 
 
 		 271 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  50 
 
 		 326 aa  274  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  49.44 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  50.56 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  48.76 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  48.15 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  46.3 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  52.07 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  49.59 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  49.59 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  49.59 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  46.04 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  45.97 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  45.8 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  42.06 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  41 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.15 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.89 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.78 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  28.01 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  28.62 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  25.7 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.05 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30.12 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  32.86 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  26.83 
 
 		 966 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  24.91 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  24.05 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  27.05 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  31.33 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  23.62 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  25 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.99 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  31.61 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.99 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.08 
 
 		 582 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  30.99 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  25.97 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  30.97 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  26.13 
 
 		 717 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  23.58 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  25.45 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.76 
 
 		 566 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  26.8 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.37 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  23.57 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  27.33 
 
 		 462 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  26.05 
 
 		 1012 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.94 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  24.29 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  30.3 
 
 		 555 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.35 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  25.8 
 
 		 796 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  25.8 
 
 		 796 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.57 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.55 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.67 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  25.81 
 
 		 784 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.05 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.75 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  25.57 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.34 
 
 		 635 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  23.1 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.51 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.27 
 
 		 657 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  29.08 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  22.45 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.16 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  22.45 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.61 
 
 		 445 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  21.77 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.8 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.43 
 
 		 498 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  26.04 
 
 		 459 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.27 
 
 		 430 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  25.45 
 
 		 433 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  25.45 
 
 		 434 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  25.45 
 
 		 434 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  26.12 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  22.7 
 
 		 348 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  25.45 
 
 		 434 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  26.62 
 
 		 785 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  22.7 
 
 		 340 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  26.98 
 
 		 381 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  27.12 
 
 		 406 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  23.47 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  22.74 
 
 		 388 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  23.27 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.82 
 
 		 501 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  23.27 
 
 		 388 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.72 
 
 		 507 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.69 
 
 		 483 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.64 
 
 		 5698 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3827  beta-lactamase  34.48 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809801  normal  0.0296333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.84 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.58 
 
 		 559 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>