More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2812 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  94.04 
 
 
392 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  86.49 
 
 
392 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  92.75 
 
 
392 aa  741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  92.75 
 
 
392 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  92.86 
 
 
392 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  93.4 
 
 
294 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  89.9 
 
 
99 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  29.6 
 
 
516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  25.94 
 
 
415 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  28.27 
 
 
443 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  28.11 
 
 
497 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  28.5 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  33.52 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  37.43 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  34.06 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.86 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.26 
 
 
621 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.53 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  32.08 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  29.38 
 
 
718 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.43 
 
 
607 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  30.65 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
826 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  32.84 
 
 
393 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.72 
 
 
405 aa  63.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  32.86 
 
 
744 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 
458 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.28 
 
 
630 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  32.24 
 
 
646 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 
616 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.93 
 
 
760 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.86 
 
 
719 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.98 
 
 
660 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  31.71 
 
 
658 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.78 
 
 
727 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.62 
 
 
715 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  30.9 
 
 
715 aa  61.6  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 
618 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 
616 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  31.16 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30 
 
 
663 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.03 
 
 
577 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.42 
 
 
730 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.77 
 
 
617 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.63 
 
 
757 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  28.65 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.56 
 
 
666 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.43 
 
 
623 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  28.98 
 
 
641 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.23 
 
 
620 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.17 
 
 
650 aa  60.5  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  34.78 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  32.37 
 
 
407 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  30.95 
 
 
700 aa  60.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.21 
 
 
721 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  30.07 
 
 
465 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  32.39 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
620 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  31.34 
 
 
400 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.21 
 
 
630 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.88 
 
 
639 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  30.07 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.06 
 
 
773 aa  59.7  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.47 
 
 
633 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  30.29 
 
 
764 aa  59.7  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2276  AAA ATPase, central region  28.49 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00996257  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  27.92 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.88 
 
 
731 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.12 
 
 
731 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.53 
 
 
713 aa  59.7  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.23 
 
 
622 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.38 
 
 
701 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.8 
 
 
812 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.99 
 
 
731 aa  59.7  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  29.81 
 
 
728 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 
738 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  29.01 
 
 
733 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.47 
 
 
731 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  33.07 
 
 
746 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  28.49 
 
 
737 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.67 
 
 
660 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
642 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
642 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.44 
 
 
754 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.37 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  30.6 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  29.5 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
640 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  34.87 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  30.57 
 
 
641 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.82 
 
 
650 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.68 
 
 
759 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 
642 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  32.37 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  31.65 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>