More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0648 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 392 aa  804    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  87.76 
 
 		 392 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  88.05 
 
 		 392 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  87.76 
 
 		 392 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  86.99 
 
 		 392 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  86.49 
 
 		 392 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  87.71 
 
 		 294 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  86.73 
 
 		 99 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  32.28 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  30.29 
 
 		 516 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  27.97 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  26.12 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 518 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  31.4 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  33.77 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.82 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.24 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  28.3 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.43 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  37.75 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.29 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  31.9 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  31.88 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  34.07 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.07 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  32.09 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.03 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  32.86 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  30.39 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.82 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.48 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.45 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  30.53 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.25 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  30.99 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 812 aa  60.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  34.73 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  29.55 
 
 		 646 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.21 
 
 		 617 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.25 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.85 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  25.93 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.96 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  30.13 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  28.04 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.77 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  31.76 
 
 		 800 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.27 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.37 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.19 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  29.75 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  26.76 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.97 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.74 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  30 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.3 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.65 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.76 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  32.14 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  29.22 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.75 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.76 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  32.67 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.09 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.02 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  30.77 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.48 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2276  AAA ATPase, central region  28.49 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00996257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.7 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.49 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.49 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.49 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  30.28 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.01 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  29.85 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.76 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  30.39 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  30.27 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 640 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  30.16 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.27 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.76 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  26.98 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30.83 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.67 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  27.18 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.49 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.11 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 623 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.13 
 
 		 631 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>