More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04110 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  100 
 
 
516 aa  1058    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  49.8 
 
 
443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  47.78 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  35.78 
 
 
650 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  29.78 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  34.87 
 
 
353 aa  126  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  30.51 
 
 
392 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  30.29 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  29.56 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  29.78 
 
 
294 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  29.78 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  28.83 
 
 
392 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  30.18 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  35.04 
 
 
734 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  34.19 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  32.74 
 
 
737 aa  77.4  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.99 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  35.71 
 
 
733 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  33.64 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.06 
 
 
738 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  34.59 
 
 
747 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  35.04 
 
 
750 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.34 
 
 
783 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  32.91 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0472  AAA family ATPase  32.14 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0845041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.79 
 
 
662 aa  73.9  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  34.05 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  34.31 
 
 
748 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  32.91 
 
 
741 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  32.91 
 
 
741 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  33.76 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  37.98 
 
 
699 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.69 
 
 
759 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  34.78 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.12 
 
 
719 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  31.71 
 
 
728 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  32.37 
 
 
713 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  32.73 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  30.86 
 
 
742 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  32.73 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 
750 aa  71.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2284  putative cell division protein  32.97 
 
 
634 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0284876 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  32.59 
 
 
599 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  34.42 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.72 
 
 
650 aa  70.9  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  35.22 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  31.21 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.9 
 
 
704 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  35.04 
 
 
749 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  29.63 
 
 
729 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1438  ATPase central domain-containing protein  27.38 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  29.82 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  29.07 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  34.42 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1486  AAA ATPase central domain protein  27.4 
 
 
586 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178945  normal  0.31164 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  34.33 
 
 
607 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  25.71 
 
 
592 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  26.34 
 
 
803 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  30.24 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  31.82 
 
 
739 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  27.32 
 
 
593 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2241  ATPase central domain-containing protein  29.7 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451188  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  32.48 
 
 
703 aa  69.3  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.69 
 
 
794 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  33.12 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  29.09 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.18 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  32.08 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.51 
 
 
659 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2630  vesicle-fusing ATPase  27.62 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.609425  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.69 
 
 
714 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  29.17 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5891  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit- like protein  27.91 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0900472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2075  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.99 
 
 
621 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000894512  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1866  AAA ATPase central domain protein  26.64 
 
 
578 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.16 
 
 
781 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  29.17 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  32.9 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4882  ATPase central domain-containing protein  27.78 
 
 
601 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000159946  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  28.27 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  28.27 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 
717 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 
713 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  28.27 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.17 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  32.64 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  28.48 
 
 
583 aa  67.4  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  28.75 
 
 
465 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
608 aa  67.4  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.99 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.85 
 
 
755 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.5 
 
 
639 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.75 
 
 
754 aa  67  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 
599 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  32.62 
 
 
756 aa  67  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  29.38 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.03 
 
 
801 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>