More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2276 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2276  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 392 aa  793    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00996257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.06 
 
 		 637 aa  235  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.85 
 
 		 611 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.75 
 
 		 610 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.46 
 
 		 636 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.5 
 
 		 610 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  31.89 
 
 		 630 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  34.42 
 
 		 665 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  32.26 
 
 		 617 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.34 
 
 		 601 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.09 
 
 		 601 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.49 
 
 		 602 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  41.02 
 
 		 628 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  32.01 
 
 		 617 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  32.35 
 
 		 619 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  32.51 
 
 		 617 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.06 
 
 		 676 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.25 
 
 		 628 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.25 
 
 		 628 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.01 
 
 		 653 aa  216  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.94 
 
 		 650 aa  216  7e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  32.49 
 
 		 623 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  31.11 
 
 		 602 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.25 
 
 		 697 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.19 
 
 		 681 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.22 
 
 		 636 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.23 
 
 		 628 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  32.28 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  33.78 
 
 		 651 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  36.81 
 
 		 715 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.23 
 
 		 631 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 632 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  34.11 
 
 		 628 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  34.59 
 
 		 648 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  32.84 
 
 		 608 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.1 
 
 		 697 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  38.28 
 
 		 632 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  33.33 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.31 
 
 		 651 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.25 
 
 		 633 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.1 
 
 		 697 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.88 
 
 		 577 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  39.45 
 
 		 633 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31 
 
 		 631 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.7 
 
 		 639 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  33.42 
 
 		 618 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  32.39 
 
 		 630 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.33 
 
 		 643 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  32.49 
 
 		 614 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.35 
 
 		 630 aa  210  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 656 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.75 
 
 		 616 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  37.13 
 
 		 615 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.92 
 
 		 617 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  37.13 
 
 		 615 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  35.95 
 
 		 641 aa  209  6e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  32.52 
 
 		 700 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.8 
 
 		 625 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.31 
 
 		 660 aa  209  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  32.89 
 
 		 637 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 		 663 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 		 663 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.66 
 
 		 620 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.37 
 
 		 696 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.85 
 
 		 630 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.1 
 
 		 641 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  32.1 
 
 		 641 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.7 
 
 		 640 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.45 
 
 		 642 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.48 
 
 		 714 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.99 
 
 		 607 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 		 697 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  31.75 
 
 		 637 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  33.16 
 
 		 637 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  33.07 
 
 		 642 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37 
 
 		 662 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  30.36 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  32.41 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  32.7 
 
 		 637 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.52 
 
 		 630 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.47 
 
 		 639 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.45 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.03 
 
 		 617 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 		 632 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.45 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 		 621 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  39.47 
 
 		 633 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.1 
 
 		 633 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.56 
 
 		 659 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  34.73 
 
 		 706 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.54 
 
 		 655 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  39.06 
 
 		 667 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.1 
 
 		 635 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>