More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2241 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  100 
 
 
415 aa  856    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  31.43 
 
 
443 aa  166  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  27.38 
 
 
650 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  28.89 
 
 
497 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  29.95 
 
 
516 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
518 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  26.33 
 
 
392 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  25.94 
 
 
392 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  26.61 
 
 
392 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  31.08 
 
 
353 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  26.51 
 
 
392 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  26.12 
 
 
392 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  26.89 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  33.92 
 
 
294 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  33.92 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  37.97 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 
633 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  29.44 
 
 
1301 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.65 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  35.26 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.73 
 
 
696 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  32.18 
 
 
803 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.47 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  27 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  36.71 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  31.4 
 
 
867 aa  77.8  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  34.46 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.73 
 
 
653 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  30.24 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29 
 
 
804 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  33.93 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  31.48 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.24 
 
 
650 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  32.05 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.09 
 
 
577 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.15 
 
 
723 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 
666 aa  76.3  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  29 
 
 
1284 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.68 
 
 
646 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.68 
 
 
646 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.23 
 
 
800 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.61 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.85 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  26.13 
 
 
663 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.65 
 
 
669 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  28.5 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.4 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  26.15 
 
 
689 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.41 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.66 
 
 
784 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.15 
 
 
698 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.98 
 
 
697 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  29.74 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  31.43 
 
 
632 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.69 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.55 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.15 
 
 
687 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.81 
 
 
781 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  25.34 
 
 
646 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.31 
 
 
685 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.55 
 
 
673 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.92 
 
 
627 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  25.68 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.56 
 
 
731 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  30.52 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.09 
 
 
772 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  31.79 
 
 
733 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  27.57 
 
 
883 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.11 
 
 
805 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.4 
 
 
682 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.7 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.7 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.185769 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  31.98 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.24 
 
 
810 aa  73.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.61 
 
 
684 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  30.64 
 
 
737 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  31.5 
 
 
552 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  30.68 
 
 
787 aa  73.6  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.84 
 
 
633 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  31.65 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.84 
 
 
633 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.84 
 
 
633 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  31.09 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.24 
 
 
750 aa  73.2  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  29.84 
 
 
734 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  30 
 
 
636 aa  73.2  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.61 
 
 
783 aa  73.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  31.58 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.65 
 
 
687 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.25 
 
 
637 aa  73.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  27.09 
 
 
721 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  25.23 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  25.23 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.41 
 
 
640 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  31.55 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  29.61 
 
 
613 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  29.24 
 
 
702 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.59 
 
 
798 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>