More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1267 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 392 aa  806    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  87.76 
 
 		 392 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  95.85 
 
 		 392 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  95.66 
 
 		 392 aa  772    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  94.04 
 
 		 392 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  94.9 
 
 		 392 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  94.9 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  94.95 
 
 		 99 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  29.6 
 
 		 516 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  29.93 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  26.51 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  26.35 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 518 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  28.99 
 
 		 650 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  32.48 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  34.06 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  35 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.68 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.54 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  33.58 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  31.37 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  32.4 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  29.03 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.43 
 
 		 607 aa  63.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  30.11 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.71 
 
 		 719 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.17 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  29.1 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.56 
 
 		 760 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  28.71 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.39 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  31.16 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  31.88 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  30.97 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 		 812 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  30.68 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.09 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  33.8 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.38 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  32.37 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.21 
 
 		 727 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.96 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.6 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.72 
 
 		 650 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  26.73 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  30.56 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  34.78 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 616 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  28.57 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.19 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  31.34 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  30.22 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.6 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.8 
 
 		 721 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.06 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  32.39 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.45 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.34 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.89 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  29.94 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  30 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.75 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.57 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.06 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.52 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  30.91 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  29.94 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  31.06 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  28.57 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.53 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  35.25 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2276  AAA ATPase, central region  25.91 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00996257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30.3 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.68 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.41 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  29.11 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.11 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.64 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.12 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  32.37 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  28.75 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  33.82 
 
 		 425 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.44 
 
 		 650 aa  57  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>